Необходимо вставить подходящее окончание в слово «крыша».
Определим падеж. Зададим вопрос: над крышами (над чем?) - творительный падеж.
Крыша - множественное число, творительный падеж.
Во множественном числе, в творительном падеже существительные имеют окончания -ами или -ями.
Ответ: над крышами