Приложение - это определение, выраженное именем существительным, согласованным с определяемым словом в падеже. Приложение может конкретизировать или уточнять определяемое слово, давать ему другое название или характеристику.
В данном случае необходимо добавить приложение, указывающее на название реки.
Река Ока течёт через Серпухов, Коломну, Муром и впадает в Волгу.
Ответ: Река Ока течёт через Серпухов, Коломну, Муром и впадает в Волгу.