5. В нижнем течении реки мы нашли старую запруду преградившую животным дорогу к водопою.

Оборот преградившую животным дорогу к водопою стоит после определяемого существительного «запруду», поэтому обособляется.

В нижнем течении реки мы нашли старую запруду, преградившую животным дорогу к водопою.